Mallerstetten gehört zur Pfarrei Hainsberg und ist somit auch ein Teil der Pfarreiengemeinschaft Dietfurt-Hainsberg-Staadorf. Ursprünglich in der Gotik erbaut, wurde das Gotteshaus des Ortes im 17. Jahrhundert neu erbaut und im Jahr 1864 abermals neu geweiht. Das Innere der Kirche ist nicht, wie in fast allen Kirchen des Umkreises, barock ausgestattet sondern zeigt Merkmale des neuromanischen Stils.